Профиль музея - комплексный. С 1981 г. Национальный музей является головным в музейном объединении, куда входят 75 музеев Республики Татарстан. В основу экспозиции положена частная коллекция А.Ф.Лихачева - известного в крае археолога, историка, коллекционера, и экспонаты научно-промышленной выставки 1890 г.

Фонды музея насчитывают свыше 700 тысяч единиц хранения и системно охватывают всю краеведческую тематику, представляя ценность для изучения истории народов Поволжья и Приуралья, в том числе тюркских. Кроме того, фонды хранят памятники истории и культуры древнейших мировых цивилизаций, западной и восточной мировых культур