Существенным рубежом в жизни здания является 1907 г. В этот год умер Леонид Казимирович Хрщонович, старейший из прихожан, который возглавлял все строительные работы в приходе. Отрадно отметить, что эстафету в этом деле перенял его сын инженер Леонид Львович Хрщонович. К этому времени назрела острая необходимость перестройки церкви, так как на фасадной стене обнаружились трещины, а на потолке - перегнившие балки. Это и неудивительно, поскольку построенный 50 лет назад костел ни разу не подвергался капитальному ремонту. Кроме того, церковь стала достаточно тесна, в особенности в праздничные дни, когда она переполнялась солдатами-католиками Казанского гарнизона. Было еще одно обстоятельство, которое требовало изменения внешнего облика церкви. Указом Николая II от 17 апреля 1905 г. "О терпимости вероисповеданий" были отменены ограничения на внешний облик церквей христианских исповеданий. Теперь они могли строиться в виде храмов, вводить символику, ставить колокольни.

Таким образом, приход решает начать работы по расширению церкви. Проект перестройки составил безвозмездно губернский инженер Л.К.Хрщонович за год до своей смерти, и, по-видимому, это была последняя работа в творчестве этого видного городского архитектора. Он также должен был осуществлять руководство за работами. Но за него это сделал инженер Леонид Львович Хрщонович - преемник и последователь своего отца.

Предполагалось возвести колокольни, две боковые каплицы и закристию, что должно было увеличить вместимость церкви на 240 человек. Внутренние работы предполагали возведение алтаря, устройство хора и пр. Строительство велось на пожертвования прихожан, среди которых были поступления в виде 15000 шт. кирпича на сумму 1950 руб., капитал в 5000 руб., завещанный Юлией Михайловной Бартон специально на постройку колоколен, и др. Деньги, собранные на венок для умершего Л.К.Хрщоновича, согласно желания вдовы Марии Хрщонович были переданы на устройство каплиц. Таким образом, необходимые для строительства средства были собраны. В этом же году работы по постройке были окончены, а в следующем году завершились работы по его отделке внутри и снаружи. 14 сентября 1908 г. церковь была открыта для богослужения и освещена.

Внешний облик костела изменился до неузнаваемости. Сохранившаяся фотография начала века позволяет оценить тот великолепный вид, который он приобрел. Скромное, едва проглядывавшее сквозь яблоневые деревья здание превратилось в сильный градостроительный акцент, формирующий силуэт не только улицы, но и всего района так называемого Арского поля.

Оформление фасадов старого костела равномерно расположенными полуциркульными окнами подтолкнуло архитектора к использованию приемов классицизма. Такой подход оказался оправданным, поскольку именно классицизм являлся определяющим стилистическим направлением для этого района. Алтарь был перенесен на западную сторону. С этой стороны к торцу был пристроен более узкий прямоугольный обьем закристии с выступом и лестничной клеткой со входом для священника.