Первичные документы должны быть составлены в момент совершения операции, а если это не представляется возможным - непосредственно по окончании операции.
Если целевые отчисления, либо членские, вступительные взносы перечислены на счет религиозного объединения в натуральной форме и затем реализованы другим предприятиям по цене приобретения, то есть не выше себестоимости (балансовой стоимости), то объединением должен делаться дополнительный расчет с учетом требований статьи 5 Закона РФ "О налоге на прибыль предприятий и организаций". В данном случае для целей налогообложения рассчитывается сумма выручки, исходя из рыночных цен реализации (в том числе на биржах) аналогичной продукция (работ, услуг), применявшихся на момент исполнения сделки Полученная сумма наценки является доходом религиозного объединения от предпринимательской деятельности, с которою должны быть уплачены налоги на добавленную стоимость и прибыль.

Пунктом 6 статьи 6 Закона Российской Федерации от 27.12.91 N 2116-1 "О налоге на прибыль предприятий и организаций" учетом изменений и дополнений, внесенных по состоянию на 21 января 1997 года, не подлежит налогообложению прибыль религиозных объединений, предприятий, находящихся в их собственности, и хозяйственных обществ, уставный капитал которых состоит полностью из вклада религиозных объединений, от культовой деятельности, производства и реализации предметов культа и предметов религиозного назначения, а также иная прибыль указанных предприятий и хозяйственных обществ в части, используемой на осуществление этими объединениями религиозной деятельности. Данная льгота не распространяется на прибыль, полученную от производства и реализации подакцизных товаров, минерального сырья, других полезных ископаемых, а также иных товаров в соответствии с перечнем, утверждаемым Правительством Российской Федерации по представлению религиозных объединений.
Такой перечень утвержден Постановлением Правительства РФ от 13.05.97 N 579, в который вошла следующая группа товаров прибыль от реализации которых не подлежит освобождению от налогообложения: шины для автомобилей, охотничьи ружья, яхты, катера (кроме специального назначения), продукция черной и цветной металлургии (кроме вторичного сырья, черных и цветных металлов и метизов); драгоценные камни и драгоценные металлы, меховые изделия (кроме изделий детского ассортимента); высококачественные изделия из хрусталя и фарфора, икра осетровых и лососевых рыб, готовая деликатесная продукция из ценных видов рыб и морепродуктов.
Кроме того, при исчислении налога на прибыль, облагаемая прибыль предприятий, учреждений, организаций любых форм собственности при фактически произведенных затратах и расходах за счет прибыли, уменьшается на суммы взносов на благотворительные цели религиозным организациям (объединениям), зарегистрированным в установленном порядке, но не более трех процентов облагаемой налогом прибыли.

Законом Российской Федерации от 13.12.91 N 2031-1 "О налоге на имущество предприятий" установлено, что данным налогом не облагается имущество религиозных объединений и организаций.